Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Chronic fatigue syndrome__20002-both_sexes-1482
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.64019465
Normalized Enrichment Score (NES)	1.169455
Nominal p-value	0.004
FDR q-value	0.1378341
FWER p-Value	0.578

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	STAT5A	93	2.789	0.0509	Yes
2	PFKFB3	134	2.603	0.1010	Yes
3	TANK	155	2.510	0.1504	Yes
4	NFKBIA	270	2.233	0.1889	Yes
5	TNFAIP8	316	2.154	0.2297	Yes
6	MAFF	378	2.060	0.2678	Yes
7	F3	467	1.956	0.3022	Yes
8	REL	504	1.917	0.3387	Yes
9	MSC	651	1.781	0.3664	Yes
10	TNFAIP2	677	1.754	0.4003	Yes
11	IL6ST	721	1.721	0.4325	Yes
12	ZBTB10	1047	1.465	0.4437	Yes
13	PLEK	1458	1.222	0.4453	Yes
14	CCL4	1553	1.169	0.4635	Yes
15	PER1	1683	1.105	0.4785	Yes
16	FJX1	1739	1.078	0.4971	Yes
17	PDLIM5	1754	1.073	0.5179	Yes
18	CXCL2	1775	1.064	0.5382	Yes
19	TNIP2	1805	1.051	0.5578	Yes
20	PTX3	1870	1.019	0.5747	Yes
21	RCAN1	2055	0.944	0.5833	Yes
22	TNIP1	2074	0.934	0.6011	Yes
23	LDLR	2097	0.924	0.6185	Yes
24	IL1A	2106	0.921	0.6365	Yes
25	KYNU	2338	0.826	0.6402	Yes
26	BTG3	2826	0.655	0.6260	No
27	GEM	3188	0.569	0.6172	No
28	TRIP10	3979	0.423	0.5814	No
29	SERPINB8	4295	0.379	0.5713	No
30	NFKBIE	4416	0.365	0.5719	No
31	NFKB2	4462	0.359	0.5766	No
32	SQSTM1	4706	0.334	0.5697	No
33	ABCA1	4919	0.313	0.5641	No
34	VEGFA	4992	0.306	0.5662	No
35	PPP1R15A	5141	0.293	0.5638	No
36	GADD45B	5791	0.243	0.5323	No
37	SLC2A3	5992	0.232	0.5257	No
38	CCL5	6199	0.221	0.5186	No
39	IFIH1	6292	0.216	0.5178	No
40	EHD1	6391	0.211	0.5165	No
41	RNF19B	6434	0.209	0.5183	No
42	NR4A1	6436	0.209	0.5225	No
43	F2RL1	6516	0.205	0.5222	No
44	LAMB3	6542	0.203	0.5249	No
45	TAP1	7176	0.175	0.4928	No
46	PHLDA1	7288	0.171	0.4901	No
47	SERPINB2	7465	0.165	0.4835	No
48	CXCL6	7513	0.163	0.4842	No
49	CLCF1	7883	0.152	0.4665	No
50	SLC2A6	7945	0.149	0.4661	No
51	PLAU	8021	0.147	0.4648	No
52	ICAM1	8256	0.139	0.4545	No
53	TNFRSF9	8469	0.133	0.4452	No
54	IL12B	8510	0.132	0.4456	No
55	SDC4	8614	0.129	0.4424	No
56	FOSL1	8806	0.124	0.4342	No
57	PANX1	8865	0.123	0.4334	No
58	IL7R	8900	0.122	0.4340	No
59	KDM6B	9048	0.118	0.4281	No
60	CDKN1A	9183	0.114	0.4229	No
61	FUT4	9198	0.114	0.4244	No
62	BIRC2	9245	0.113	0.4241	No
63	OLR1	9363	0.110	0.4197	No
64	DENND5A	9478	0.108	0.4155	No
65	DNAJB4	9483	0.108	0.4174	No
66	IL15RA	9529	0.107	0.4170	No
67	IFNGR2	9703	0.103	0.4094	No
68	TNC	9741	0.102	0.4094	No
69	SPHK1	9808	0.100	0.4077	No
70	NFE2L2	10309	0.091	0.3815	No
71	DUSP5	10424	0.090	0.3769	No
72	AREG	10470	0.089	0.3761	No
73	BTG2	10578	0.087	0.3719	No
74	NFAT5	10850	0.082	0.3583	No
75	EDN1	10914	0.081	0.3564	No
76	SLC16A6	11270	0.075	0.3380	No
77	TIPARP	11271	0.075	0.3395	No
78	TRAF1	11280	0.075	0.3405	No
79	CD83	11310	0.074	0.3404	No
80	CD69	11632	0.069	0.3238	No
81	SGK1	11633	0.069	0.3252	No
82	MCL1	11651	0.069	0.3256	No
83	PHLDA2	11853	0.066	0.3156	No
84	IRS2	11971	0.064	0.3104	No
85	PLAUR	12009	0.064	0.3096	No
86	IL23A	12376	0.059	0.2902	No
87	YRDC	12436	0.058	0.2881	No
88	RIPK2	12559	0.056	0.2823	No
89	TRIB1	12625	0.055	0.2798	No
90	PNRC1	12643	0.055	0.2800	No
91	DUSP2	12681	0.055	0.2790	No
92	ATF3	12813	0.053	0.2727	No
93	GFPT2	12864	0.052	0.2709	No
94	BIRC3	12991	0.051	0.2649	No
95	CXCL1	13293	0.047	0.2489	No
96	BCL2A1	13414	0.045	0.2431	No
97	KLF2	13430	0.045	0.2432	No
98	DRAM1	13623	0.042	0.2332	No
99	SOD2	13630	0.042	0.2337	No
100	B4GALT1	13714	0.041	0.2299	No
101	KLF10	13766	0.040	0.2278	No
102	PTGER4	14010	0.036	0.2149	No
103	IER2	14066	0.035	0.2125	No
104	PLK2	14080	0.035	0.2125	No
105	DUSP1	14149	0.033	0.2093	No
106	INHBA	14354	0.026	0.1984	No
107	BTG1	14396	0.022	0.1966	No
108	KLF6	14423	0.021	0.1955	No
109	BMP2	14448	0.020	0.1946	No
110	NR4A2	14450	0.020	0.1949	No
111	CFLAR	14534	-0.000	0.1903	No
112	CD44	14614	-0.000	0.1858	No
113	MAP2K3	14622	-0.000	0.1854	No
114	MXD1	14670	-0.000	0.1828	No
115	BCL3	14715	-0.000	0.1803	No
116	ATP2B1	14728	-0.000	0.1796	No
117	PTGS2	14745	-0.000	0.1787	No
118	FOSL2	14755	-0.000	0.1782	No
119	JAG1	14955	-0.000	0.1671	No
120	TSC22D1	15023	-0.000	0.1633	No
121	RELB	15052	-0.000	0.1617	No
122	NAMPT	15086	-0.000	0.1599	No
123	MAP3K8	15139	-0.000	0.1570	No
124	CCL2	15158	-0.000	0.1560	No
125	NFKB1	15179	-0.000	0.1548	No
126	CCND1	15191	-0.000	0.1542	No
127	HBEGF	15262	-0.000	0.1503	No
128	BCL6	15287	-0.000	0.1489	No
129	HES1	15293	-0.000	0.1487	No
130	CCL20	15302	-0.000	0.1482	No
131	ID2	15330	-0.000	0.1467	No
132	GADD45A	15351	-0.000	0.1456	No
133	TNFAIP3	15390	-0.000	0.1434	No
134	KLF9	15401	-0.000	0.1429	No
135	NR4A3	15407	-0.000	0.1426	No
136	EGR1	15450	-0.000	0.1402	No
137	DUSP4	15455	-0.000	0.1400	No
138	CD80	15469	-0.000	0.1393	No
139	EGR2	15499	-0.000	0.1377	No
140	PMEPA1	15538	-0.000	0.1355	No
141	IRF1	15558	-0.000	0.1345	No
142	IL1B	15568	-0.000	0.1339	No
143	TNFSF9	15571	-0.000	0.1338	No
144	FOSB	15574	-0.000	0.1337	No
145	ZFP36	15627	-0.000	0.1308	No
146	LIF	15635	-0.000	0.1304	No
147	SAT1	15668	-0.000	0.1286	No
148	NINJ1	15718	-0.000	0.1259	No
149	GCH1	15732	-0.000	0.1251	No
150	BHLHE40	15778	-0.000	0.1226	No
151	IL6	15843	-0.000	0.1190	No
152	KLF4	15860	-0.000	0.1181	No
153	MYC	15873	-0.000	0.1174	No
154	TUBB2A	15884	-0.000	0.1169	No
155	IER3	15886	-0.000	0.1168	No
156	TLR2	15888	-0.000	0.1168	No
157	CCN1	16014	-0.000	0.1098	No
158	RHOB	16045	-0.000	0.1081	No
159	ACKR3	16059	-0.000	0.1073	No
160	IL18	16176	-0.000	0.1008	No
161	ETS2	16305	-0.000	0.0936	No
162	B4GALT5	16327	-0.000	0.0925	No
163	PLPP3	16410	-0.000	0.0879	No
164	IER5	16427	-0.000	0.0870	No
165	CCNL1	16471	-0.000	0.0845	No
166	CXCL3	16475	-0.000	0.0844	No
167	ZC3H12A	16482	-0.000	0.0840	No
168	CSF2	16515	-0.000	0.0822	No
169	NFIL3	16546	-0.000	0.0806	No
170	SMAD3	16632	-0.000	0.0758	No
171	EFNA1	16735	-0.000	0.0701	No
172	CXCL10	16736	-0.000	0.0701	No
173	CXCL11	16737	-0.000	0.0701	No
174	GPR183	16748	-0.000	0.0695	No
175	FOS	16780	-0.000	0.0678	No
176	JUNB	16825	-0.000	0.0653	No
177	SPSB1	16847	-0.000	0.0641	No
178	CEBPB	16869	-0.000	0.0629	No
179	RELA	16902	-0.000	0.0611	No
180	EIF1	16928	-0.000	0.0597	No
181	TGIF1	17025	-0.000	0.0543	No
182	JUN	17035	-0.000	0.0538	No
183	EGR3	17076	-0.000	0.0516	No
184	CSF1	17230	-0.000	0.0430	No
185	SOCS3	17241	-0.000	0.0424	No
186	PDE4B	17242	-0.000	0.0424	No
187	SNN	17243	-0.000	0.0424	No
188	LITAF	17402	-0.000	0.0336	No
189	CEBPD	17733	-0.000	0.0150	No
190	TNF	17767	-0.000	0.0132	No
191	MARCKS	17959	-0.000	0.0025	No