Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Chronic fatigue syndrome__20002-both_sexes-1482
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.5950715
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0905259
Nominal p-value	0.05
FDR q-value	0.38735765
FWER p-Value	0.998

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PDK1	8	3.901	0.0577	Yes
2	PFKFB3	134	2.603	0.0895	Yes
3	HS3ST1	225	2.326	0.1192	Yes
4	MAFF	378	2.060	0.1414	Yes
5	CAVIN3	440	1.988	0.1676	Yes
6	F3	467	1.956	0.1953	Yes
7	PDK3	548	1.880	0.2189	Yes
8	SDC3	560	1.871	0.2462	Yes
9	SRPX	565	1.865	0.2737	Yes
10	CHST2	575	1.853	0.3009	Yes
11	TPD52	581	1.850	0.3282	Yes
12	NAGK	674	1.759	0.3492	Yes
13	BGN	799	1.643	0.3668	Yes
14	JMJD6	878	1.578	0.3860	Yes
15	MT2A	882	1.575	0.4093	Yes
16	DDIT4	1032	1.475	0.4229	Yes
17	SELENBP1	1443	1.233	0.4183	Yes
18	B4GALNT2	1823	1.042	0.4125	Yes
19	GRHPR	1850	1.030	0.4264	Yes
20	GALK1	1917	0.998	0.4376	Yes
21	KLHL24	2049	0.946	0.4444	Yes
22	CHST3	2189	0.885	0.4497	Yes
23	UGP2	2324	0.831	0.4546	Yes
24	GBE1	2328	0.829	0.4668	Yes
25	PGM1	2357	0.818	0.4774	Yes
26	ADORA2B	2359	0.818	0.4896	Yes
27	GYS1	2533	0.751	0.4911	Yes
28	WSB1	2549	0.746	0.5014	Yes
29	PKLR	2602	0.728	0.5093	Yes
30	DPYSL4	2633	0.713	0.5182	Yes
31	FAM162A	2663	0.704	0.5271	Yes
32	PFKL	2830	0.654	0.5275	Yes
33	GAPDH	2890	0.639	0.5338	Yes
34	AMPD3	2959	0.621	0.5392	Yes
35	TPBG	2974	0.618	0.5476	Yes
36	IGFBP1	2977	0.618	0.5567	Yes
37	PYGM	3094	0.589	0.5590	Yes
38	ANKZF1	3170	0.572	0.5633	Yes
39	NDST2	3265	0.548	0.5662	Yes
40	LXN	3316	0.540	0.5715	Yes
41	LDHC	3339	0.535	0.5782	Yes
42	HEXA	3484	0.506	0.5777	Yes
43	KDELR3	3625	0.480	0.5770	Yes
44	PGAM2	3676	0.469	0.5812	Yes
45	ENO3	3811	0.447	0.5803	Yes
46	STBD1	3829	0.445	0.5860	Yes
47	PCK1	3861	0.440	0.5908	Yes
48	GCNT2	3971	0.424	0.5910	Yes
49	GAPDHS	4066	0.411	0.5919	Yes
50	FBP1	4237	0.386	0.5881	Yes
51	CP	4333	0.373	0.5883	Yes
52	CA12	4338	0.373	0.5937	Yes
53	VLDLR	4411	0.366	0.5951	Yes
54	ZNF292	4609	0.344	0.5891	No
55	ALDOB	4791	0.325	0.5838	No
56	VEGFA	4992	0.306	0.5772	No
57	CASP6	5043	0.302	0.5789	No
58	ERRFI1	5130	0.294	0.5784	No
59	PPP1R15A	5141	0.293	0.5822	No
60	SCARB1	5270	0.281	0.5792	No
61	PGM2	5276	0.281	0.5832	No
62	BCAN	5320	0.278	0.5849	No
63	ILVBL	5380	0.272	0.5856	No
64	B3GALT6	5406	0.270	0.5883	No
65	SLC25A1	5425	0.269	0.5913	No
66	LDHA	5673	0.251	0.5811	No
67	SLC2A3	5992	0.232	0.5667	No
68	PLIN2	6004	0.231	0.5696	No
69	PHKG1	6224	0.220	0.5605	No
70	ENO1	6590	0.201	0.5430	No
71	SLC2A5	6648	0.198	0.5428	No
72	MT1E	6702	0.195	0.5427	No
73	NCAN	6936	0.186	0.5324	No
74	CCN5	7340	0.169	0.5123	No
75	NDRG1	7505	0.164	0.5055	No
76	GPI	7627	0.160	0.5011	No
77	HMOX1	8162	0.142	0.4733	No
78	PAM	8283	0.138	0.4686	No
79	TPI1	8301	0.137	0.4697	No
80	NDST1	8609	0.129	0.4543	No
81	SDC4	8614	0.129	0.4560	No
82	NOCT	8645	0.128	0.4563	No
83	SULT2B1	8855	0.123	0.4464	No
84	HK2	9065	0.118	0.4364	No
85	CDKN1A	9183	0.114	0.4315	No
86	RORA	9263	0.112	0.4288	No
87	ALDOC	9298	0.112	0.4285	No
88	MIF	9386	0.109	0.4253	No
89	EGFR	9576	0.106	0.4162	No
90	ANXA2	9746	0.102	0.4082	No
91	LARGE1	9847	0.100	0.4041	No
92	ERO1A	10085	0.095	0.3922	No
93	TMEM45A	10232	0.093	0.3854	No
94	CCNG2	10249	0.092	0.3859	No
95	AKAP12	10300	0.091	0.3845	No
96	PPP1R3C	10493	0.088	0.3750	No
97	TGFBI	10535	0.088	0.3740	No
98	TPST2	10570	0.087	0.3734	No
99	PFKP	10656	0.085	0.3699	No
100	MAP3K1	10750	0.084	0.3659	No
101	PRKCA	10934	0.080	0.3568	No
102	SLC37A4	11094	0.077	0.3491	No
103	MYH9	11259	0.075	0.3410	No
104	TIPARP	11271	0.075	0.3415	No
105	ALDOA	11342	0.074	0.3386	No
106	CAVIN1	11438	0.073	0.3344	No
107	PPARGC1A	11489	0.072	0.3327	No
108	CAV1	11600	0.070	0.3275	No
109	XPNPEP1	11749	0.068	0.3202	No
110	GLRX	11783	0.067	0.3194	No
111	HOXB9	11872	0.066	0.3154	No
112	HK1	11964	0.064	0.3113	No
113	IRS2	11971	0.064	0.3119	No
114	PLAUR	12009	0.064	0.3107	No
115	ENO2	12012	0.064	0.3116	No
116	GPC1	12324	0.060	0.2950	No
117	ISG20	12387	0.059	0.2924	No
118	GCK	12497	0.057	0.2871	No
119	NEDD4L	12504	0.057	0.2876	No
120	PNRC1	12643	0.055	0.2807	No
121	AK4	12646	0.055	0.2814	No
122	TGM2	12754	0.054	0.2762	No
123	P4HA1	12758	0.053	0.2769	No
124	DTNA	12764	0.053	0.2774	No
125	ATF3	12813	0.053	0.2755	No
126	P4HA2	12865	0.052	0.2734	No
127	IGFBP3	12916	0.051	0.2713	No
128	DDIT3	12990	0.051	0.2680	No
129	CSRP2	13007	0.050	0.2678	No
130	PPFIA4	13028	0.050	0.2675	No
131	HDLBP	13090	0.049	0.2648	No
132	MXI1	13139	0.048	0.2628	No
133	SLC6A6	13244	0.047	0.2577	No
134	INHA	13249	0.047	0.2581	No
135	KIF5A	13588	0.042	0.2398	No
136	HSPA5	13713	0.041	0.2334	No
137	EFNA3	13759	0.040	0.2315	No
138	NR3C1	13893	0.038	0.2246	No
139	DUSP1	14149	0.033	0.2108	No
140	PGK1	14242	0.031	0.2061	No
141	TKTL1	14253	0.031	0.2060	No
142	BTG1	14396	0.022	0.1983	No
143	KLF6	14423	0.021	0.1972	No
144	ATP7A	14443	0.020	0.1964	No
145	KLF7	14458	0.019	0.1959	No
146	ADM	14493	0.016	0.1942	No
147	IDS	14581	-0.000	0.1894	No
148	DCN	14589	-0.000	0.1890	No
149	RRAGD	14611	-0.000	0.1878	No
150	FOSL2	14755	-0.000	0.1798	No
151	GPC4	14764	-0.000	0.1793	No
152	PDGFB	14907	-0.000	0.1713	No
153	BRS3	15006	-0.000	0.1658	No
154	BNIP3L	15050	-0.000	0.1634	No
155	HAS1	15071	-0.000	0.1623	No
156	CDKN1B	15217	-0.000	0.1542	No
157	LOX	15264	-0.000	0.1516	No
158	STC2	15284	-0.000	0.1505	No
159	KDM3A	15327	-0.000	0.1481	No
160	SLC2A1	15365	-0.000	0.1461	No
161	TNFAIP3	15390	-0.000	0.1447	No
162	CCN2	15391	-0.000	0.1447	No
163	FOXO3	15393	-0.000	0.1447	No
164	PGF	15409	-0.000	0.1438	No
165	TGFB3	15412	-0.000	0.1437	No
166	CXCR4	15475	-0.000	0.1402	No
167	PRDX5	15600	-0.000	0.1333	No
168	EDN2	15612	-0.000	0.1326	No
169	ZFP36	15627	-0.000	0.1319	No
170	CDKN1C	15664	-0.000	0.1298	No
171	COL5A1	15681	-0.000	0.1289	No
172	VHL	15777	-0.000	0.1236	No
173	BHLHE40	15778	-0.000	0.1236	No
174	ETS1	15799	-0.000	0.1225	No
175	TES	15810	-0.000	0.1219	No
176	IL6	15843	-0.000	0.1201	No
177	PIM1	15881	-0.000	0.1180	No
178	IER3	15886	-0.000	0.1178	No
179	CCN1	16014	-0.000	0.1107	No
180	ACKR3	16059	-0.000	0.1082	No
181	PLAC8	16078	-0.000	0.1072	No
182	GPC3	16128	-0.000	0.1045	No
183	STC1	16344	-0.000	0.0924	No
184	SAP30	16497	-0.000	0.0838	No
185	CITED2	16516	-0.000	0.0828	No
186	NFIL3	16546	-0.000	0.0812	No
187	LALBA	16654	-0.000	0.0752	No
188	RBPJ	16683	-0.000	0.0736	No
189	EFNA1	16735	-0.000	0.0708	No
190	SDC2	16745	-0.000	0.0703	No
191	FOS	16780	-0.000	0.0683	No
192	GAA	16828	-0.000	0.0657	No
193	BCL2	16852	-0.000	0.0644	No
194	JUN	17035	-0.000	0.0542	No
195	SIAH2	17137	-0.000	0.0485	No
196	EXT1	17147	-0.000	0.0480	No
197	S100A4	17423	-0.000	0.0326	No