Details for gene set HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Chronic fatigue syndrome__20002-both_sexes-1482
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION
Enrichment Score (ES)	0.5762298
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0540587
Nominal p-value	0.192
FDR q-value	0.6086317
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	FERMT2	40	3.191	0.0428	Yes
2	MXRA5	41	3.163	0.0875	Yes
3	TNFRSF11B	63	2.939	0.1278	Yes
4	COL6A2	71	2.902	0.1684	Yes
5	LRP1	304	2.171	0.1860	Yes
6	CDH11	364	2.082	0.2121	Yes
7	MMP14	384	2.049	0.2400	Yes
8	CALD1	390	2.039	0.2685	Yes
9	VIM	433	1.995	0.2943	Yes
10	COL11A1	491	1.928	0.3183	Yes
11	BGN	799	1.643	0.3243	Yes
12	SFRP4	812	1.631	0.3466	Yes
13	COL8A2	831	1.617	0.3684	Yes
14	TIMP3	884	1.573	0.3877	Yes
15	THY1	891	1.571	0.4096	Yes
16	DST	948	1.531	0.4281	Yes
17	SLIT3	1046	1.465	0.4433	Yes
18	PRSS2	1056	1.461	0.4634	Yes
19	LAMA1	1135	1.406	0.4789	Yes
20	COL16A1	1144	1.401	0.4982	Yes
21	GAS1	1230	1.354	0.5126	Yes
22	SDC1	1332	1.302	0.5253	Yes
23	GLIPR1	1550	1.169	0.5296	Yes
24	SLIT2	1770	1.068	0.5324	Yes
25	PTX3	1870	1.019	0.5412	Yes
26	ANPEP	2152	0.903	0.5382	Yes
27	SPP1	2477	0.773	0.5309	Yes
28	FUCA1	2575	0.736	0.5359	Yes
29	ELN	2677	0.700	0.5401	Yes
30	CALU	2707	0.689	0.5482	Yes
31	THBS2	2825	0.655	0.5509	Yes
32	LOXL2	2827	0.654	0.5600	Yes
33	ITGB3	3163	0.573	0.5493	Yes
34	GEM	3188	0.569	0.5560	Yes
35	BMP1	3211	0.560	0.5627	Yes
36	COL6A3	3260	0.549	0.5677	Yes
37	COL5A3	3533	0.497	0.5595	Yes
38	COL12A1	3602	0.484	0.5625	Yes
39	ECM1	3688	0.467	0.5643	Yes
40	FGF2	3740	0.458	0.5679	Yes
41	OXTR	3845	0.443	0.5684	Yes
42	SGCG	3892	0.434	0.5719	Yes
43	TPM2	3924	0.430	0.5762	Yes
44	FBLN2	4030	0.417	0.5762	No
45	MGP	4278	0.381	0.5677	No
46	IL32	4723	0.332	0.5475	No
47	LAMC2	4737	0.330	0.5514	No
48	HTRA1	4745	0.330	0.5557	No
49	MYLK	4760	0.329	0.5595	No
50	CAPG	4799	0.325	0.5620	No
51	PCOLCE2	4839	0.321	0.5643	No
52	ECM2	4907	0.314	0.5650	No
53	QSOX1	4914	0.314	0.5691	No
54	VEGFA	4992	0.306	0.5691	No
55	RGS4	5104	0.297	0.5671	No
56	FN1	5479	0.265	0.5498	No
57	CXCL8	5482	0.265	0.5534	No
58	PLOD2	5533	0.261	0.5543	No
59	GPX7	5542	0.261	0.5575	No
60	GADD45B	5791	0.243	0.5470	No
61	MATN3	5850	0.240	0.5472	No
62	TFPI2	5883	0.237	0.5487	No
63	COLGALT1	5961	0.233	0.5477	No
64	PCOLCE	5963	0.233	0.5509	No
65	PLOD1	6235	0.219	0.5388	No
66	SNTB1	6358	0.212	0.5349	No
67	PVR	6428	0.209	0.5340	No
68	MMP3	6468	0.207	0.5348	No
69	MFAP5	6547	0.203	0.5332	No
70	COMP	6771	0.192	0.5234	No
71	LAMA2	7082	0.179	0.5086	No
72	P3H1	7191	0.175	0.5050	No
73	MATN2	7230	0.173	0.5053	No
74	CXCL6	7513	0.163	0.4917	No
75	CRLF1	7689	0.157	0.4841	No
76	COL4A2	8004	0.147	0.4686	No
77	IGFBP4	8061	0.145	0.4675	No
78	BDNF	8078	0.145	0.4686	No
79	PDGFRB	8110	0.144	0.4689	No
80	FBN2	8196	0.141	0.4661	No
81	TGFBR3	8205	0.141	0.4677	No
82	ITGB5	8234	0.139	0.4681	No
83	CTHRC1	8339	0.136	0.4642	No
84	FBLN1	8430	0.134	0.4610	No
85	CAP2	8518	0.132	0.4580	No
86	SDC4	8614	0.129	0.4544	No
87	LAMA3	8796	0.124	0.4460	No
88	NT5E	8962	0.120	0.4385	No
89	APLP1	8998	0.119	0.4382	No
90	PPIB	9055	0.118	0.4367	No
91	SGCB	9069	0.117	0.4376	No
92	TNFRSF12A	9140	0.115	0.4353	No
93	FZD8	9274	0.112	0.4294	No
94	LOXL1	9446	0.108	0.4214	No
95	IGFBP2	9481	0.108	0.4210	No
96	SGCD	9490	0.107	0.4220	No
97	COL7A1	9637	0.104	0.4153	No
98	TNC	9741	0.102	0.4110	No
99	SERPINH1	9761	0.101	0.4113	No
100	MCM7	9913	0.099	0.4043	No
101	MMP1	10029	0.096	0.3992	No
102	ITGA5	10076	0.096	0.3979	No
103	LGALS1	10187	0.094	0.3931	No
104	EMP3	10206	0.093	0.3934	No
105	VCAM1	10381	0.090	0.3849	No
106	AREG	10470	0.089	0.3812	No
107	SLC6A8	10483	0.089	0.3818	No
108	TGFBI	10535	0.088	0.3801	No
109	MMP2	10620	0.086	0.3766	No
110	COL1A1	10755	0.084	0.3703	No
111	THBS1	11178	0.077	0.3477	No
112	ITGAV	11241	0.076	0.3453	No
113	EFEMP2	11551	0.071	0.3289	No
114	COL4A1	11569	0.071	0.3290	No
115	LRRC15	11614	0.070	0.3275	No
116	FAP	11810	0.067	0.3175	No
117	NOTCH2	12003	0.064	0.3076	No
118	PLAUR	12009	0.064	0.3082	No
119	ENO2	12012	0.064	0.3090	No
120	VCAN	12201	0.061	0.2993	No
121	COL1A2	12228	0.061	0.2987	No
122	DAB2	12238	0.061	0.2990	No
123	FSTL3	12296	0.060	0.2967	No
124	GPC1	12324	0.060	0.2960	No
125	ADAM12	12331	0.060	0.2965	No
126	SCG2	12425	0.058	0.2921	No
127	MEST	12438	0.058	0.2923	No
128	TAGLN	12548	0.056	0.2869	No
129	FSTL1	12566	0.056	0.2868	No
130	MYL9	12581	0.056	0.2868	No
131	LAMC1	12644	0.055	0.2841	No
132	TGM2	12754	0.054	0.2787	No
133	TPM4	12848	0.052	0.2742	No
134	DPYSL3	12904	0.052	0.2719	No
135	IGFBP3	12916	0.051	0.2720	No
136	FBLN5	12987	0.051	0.2688	No
137	COL5A2	13119	0.049	0.2621	No
138	ITGB1	13126	0.049	0.2624	No
139	TPM1	13188	0.048	0.2597	No
140	CXCL1	13293	0.047	0.2545	No
141	WIPF1	13376	0.046	0.2505	No
142	COL3A1	13400	0.045	0.2499	No
143	GJA1	13523	0.043	0.2437	No
144	PDLIM4	13613	0.042	0.2392	No
145	CDH6	13624	0.042	0.2393	No
146	SPOCK1	13660	0.041	0.2379	No
147	FBN1	13706	0.041	0.2359	No
148	IL15	13778	0.040	0.2325	No
149	FMOD	13943	0.037	0.2238	No
150	SFRP1	14065	0.035	0.2175	No
151	NTM	14249	0.031	0.2077	No
152	INHBA	14354	0.026	0.2022	No
153	PFN2	14503	0.015	0.1941	No
154	DCN	14589	-0.000	0.1894	No
155	SNAI2	14604	-0.000	0.1886	No
156	CD44	14614	-0.000	0.1881	No
157	CD59	14809	-0.000	0.1772	No
158	PTHLH	14824	-0.000	0.1764	No
159	TIMP1	15009	-0.000	0.1660	No
160	TGFB1	15066	-0.000	0.1629	No
161	CXCL12	15128	-0.000	0.1595	No
162	ACTA2	15133	-0.000	0.1593	No
163	DKK1	15140	-0.000	0.1589	No
164	PMP22	15171	-0.000	0.1572	No
165	LOX	15264	-0.000	0.1521	No
166	SPARC	15265	-0.000	0.1521	No
167	WNT5A	15291	-0.000	0.1507	No
168	ID2	15330	-0.000	0.1485	No
169	PRRX1	15338	-0.000	0.1481	No
170	GADD45A	15351	-0.000	0.1475	No
171	TNFAIP3	15390	-0.000	0.1453	No
172	CCN2	15391	-0.000	0.1453	No
173	COPA	15481	-0.000	0.1403	No
174	PMEPA1	15538	-0.000	0.1372	No
175	SAT1	15668	-0.000	0.1299	No
176	COL5A1	15681	-0.000	0.1293	No
177	POSTN	15760	-0.000	0.1249	No
178	SERPINE2	15830	-0.000	0.1210	No
179	IL6	15843	-0.000	0.1203	No
180	LUM	15937	-0.000	0.1151	No
181	CCN1	16014	-0.000	0.1108	No
182	RHOB	16045	-0.000	0.1092	No
183	VEGFC	16174	-0.000	0.1020	No
184	ABI3BP	16242	-0.000	0.0982	No
185	MSX1	16442	-0.000	0.0870	No
186	ITGA2	16506	-0.000	0.0835	No
187	EDIL3	16507	-0.000	0.0835	No
188	NNMT	16618	-0.000	0.0773	No
189	GREM1	16631	-0.000	0.0767	No
190	CDH2	16792	-0.000	0.0677	No
191	FOXC2	17009	-0.000	0.0555	No
192	BASP1	17014	-0.000	0.0553	No
193	JUN	17035	-0.000	0.0542	No
194	CADM1	17176	-0.000	0.0463	No
195	FLNA	17474	-0.000	0.0296	No
196	MAGEE1	17582	-0.000	0.0236	No