Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Chronic fatigue syndrome__20002-both_sexes-1482
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	HALLMARK_COMPLEMENT
Enrichment Score (ES)	0.57979196
Normalized Enrichment Score (NES)	1.059453
Nominal p-value	0.141
FDR q-value	0.6141764
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	JAK2	29	3.319	0.0472	Yes
2	LRP1	304	2.171	0.0637	Yes
3	MAFF	378	2.060	0.0899	Yes
4	MMP14	384	2.049	0.1197	Yes
5	PSEN1	386	2.048	0.1498	Yes
6	S100A12	418	2.008	0.1776	Yes
7	RCE1	424	2.004	0.2068	Yes
8	C4BPB	435	1.992	0.2355	Yes
9	F3	467	1.956	0.2625	Yes
10	DGKG	529	1.897	0.2870	Yes
11	MSRB1	631	1.798	0.3077	Yes
12	CASP3	637	1.789	0.3337	Yes
13	PDP1	792	1.654	0.3494	Yes
14	DOCK4	842	1.610	0.3703	Yes
15	PLSCR1	902	1.560	0.3900	Yes
16	CTSB	1131	1.409	0.3979	Yes
17	GZMB	1257	1.343	0.4106	Yes
18	USP14	1307	1.318	0.4272	Yes
19	CASP4	1341	1.295	0.4444	Yes
20	CPM	1385	1.267	0.4606	Yes
21	ATOX1	1428	1.246	0.4766	Yes
22	PRSS3	1452	1.226	0.4933	Yes
23	PLEK	1458	1.222	0.5110	Yes
24	CTSV	1527	1.183	0.5246	Yes
25	APOC1	1716	1.091	0.5300	Yes
26	DGKH	2109	0.920	0.5216	Yes
27	GCA	2147	0.906	0.5328	Yes
28	PIK3R5	2220	0.873	0.5416	Yes
29	GNB2	2290	0.844	0.5501	Yes
30	IRF2	2310	0.834	0.5613	Yes
31	KYNU	2338	0.826	0.5719	Yes
32	IRF7	2587	0.732	0.5688	Yes
33	DOCK10	2775	0.667	0.5681	Yes
34	LTF	3036	0.603	0.5624	Yes
35	SH2B3	3082	0.592	0.5685	Yes
36	RABIF	3101	0.586	0.5761	Yes
37	ADRA2B	3424	0.519	0.5657	Yes
38	SIRT6	3441	0.516	0.5724	Yes
39	CTSC	3553	0.494	0.5734	Yes
40	KLKB1	3714	0.463	0.5712	Yes
41	PLAT	3716	0.462	0.5780	Yes
42	MMP13	3836	0.444	0.5778	Yes
43	F7	4088	0.407	0.5697	Yes
44	ERAP2	4111	0.403	0.5744	Yes
45	C2	4168	0.395	0.5771	Yes
46	TMPRSS6	4326	0.374	0.5737	Yes
47	CP	4333	0.373	0.5789	Yes
48	PCSK9	4520	0.353	0.5736	Yes
49	NOTCH4	4535	0.352	0.5780	Yes
50	CASP9	4595	0.345	0.5798	Yes
51	PSMB9	4772	0.328	0.5747	No
52	APOA4	4865	0.319	0.5743	No
53	LIPA	5070	0.299	0.5672	No
54	LAP3	5250	0.283	0.5613	No
55	USP16	5384	0.272	0.5578	No
56	FN1	5479	0.265	0.5565	No
57	ANXA5	5491	0.264	0.5597	No
58	CPQ	5548	0.260	0.5604	No
59	PRCP	5709	0.248	0.5551	No
60	CASP5	5767	0.245	0.5555	No
61	GZMA	5783	0.243	0.5582	No
62	TFPI2	5883	0.237	0.5561	No
63	CCL5	6199	0.221	0.5417	No
64	MMP12	6315	0.215	0.5384	No
65	EHD1	6391	0.211	0.5373	No
66	CTSO	6614	0.199	0.5278	No
67	CD36	6622	0.199	0.5303	No
68	CD55	6672	0.197	0.5304	No
69	PRDM4	6758	0.193	0.5285	No
70	LGALS3	6790	0.191	0.5296	No
71	KLK1	7027	0.181	0.5190	No
72	SCG3	7036	0.181	0.5212	No
73	CFB	7136	0.177	0.5182	No
74	LCK	7146	0.176	0.5203	No
75	C9	7351	0.169	0.5113	No
76	SERPINB2	7465	0.165	0.5074	No
77	LCP2	7865	0.152	0.4873	No
78	COL4A2	8004	0.147	0.4817	No
79	FCN1	8145	0.142	0.4759	No
80	DOCK9	8429	0.134	0.4620	No
81	PRSS36	8433	0.134	0.4638	No
82	PLG	8459	0.133	0.4643	No
83	RBSN	8702	0.127	0.4526	No
84	GP1BA	8993	0.119	0.4381	No
85	CASP10	9015	0.119	0.4387	No
86	PREP	9053	0.118	0.4383	No
87	GZMK	9122	0.116	0.4362	No
88	OLR1	9363	0.110	0.4243	No
89	MMP8	9371	0.110	0.4256	No
90	CFH	9492	0.107	0.4204	No
91	CR1	9565	0.106	0.4179	No
92	LGMN	9645	0.104	0.4150	No
93	APOBEC3F	9710	0.103	0.4129	No
94	ITGAM	9770	0.101	0.4111	No
95	ITIH1	9820	0.100	0.4098	No
96	STX4	9921	0.098	0.4057	No
97	CBLB	10002	0.097	0.4026	No
98	GNAI3	10073	0.096	0.4001	No
99	FDX1	10231	0.093	0.3926	No
100	F2	10336	0.091	0.3881	No
101	DUSP5	10424	0.090	0.3845	No
102	CTSL	10464	0.089	0.3837	No
103	DPP4	10539	0.088	0.3808	No
104	RASGRP1	10560	0.087	0.3810	No
105	GNB4	10668	0.085	0.3762	No
106	F10	10693	0.085	0.3761	No
107	KCNIP3	10719	0.084	0.3759	No
108	SERPINA1	10787	0.083	0.3734	No
109	PCLO	10813	0.082	0.3732	No
110	CDA	10857	0.082	0.3720	No
111	ACTN2	10988	0.079	0.3659	No
112	MMP15	11027	0.079	0.3649	No
113	CASP1	11202	0.076	0.3562	No
114	APOBEC3G	11282	0.075	0.3529	No
115	PRKCD	11450	0.072	0.3446	No
116	CDH13	11626	0.070	0.3358	No
117	XPNPEP1	11749	0.068	0.3299	No
118	PLAUR	12009	0.064	0.3163	No
119	CLU	12010	0.064	0.3173	No
120	CTSS	12182	0.061	0.3086	No
121	PLA2G4A	12237	0.061	0.3064	No
122	CA2	12332	0.060	0.3020	No
123	SPOCK2	12415	0.058	0.2983	No
124	CTSH	12801	0.053	0.2774	No
125	CXCL1	13293	0.047	0.2506	No
126	BRPF3	13385	0.045	0.2461	No
127	HPCAL4	13562	0.042	0.2369	No
128	S100A9	13568	0.042	0.2372	No
129	AKAP10	13581	0.042	0.2371	No
130	CD40LG	13704	0.041	0.2309	No
131	PIK3CA	13712	0.041	0.2311	No
132	HSPA5	13713	0.041	0.2317	No
133	CASP7	13751	0.040	0.2302	No
134	KCNIP2	13817	0.039	0.2271	No
135	PPP2CB	13852	0.039	0.2258	No
136	C3	13925	0.037	0.2223	No
137	DYRK2	13965	0.037	0.2207	No
138	DUSP6	13985	0.036	0.2201	No
139	KIF2A	14155	0.033	0.2111	No
140	PFN1	14264	0.030	0.2055	No
141	GRB2	14267	0.030	0.2058	No
142	WAS	14332	0.027	0.2026	No
143	GNGT2	14383	0.023	0.2002	No
144	RHOG	14483	0.017	0.1949	No
145	LAMP2	14552	-0.000	0.1911	No
146	FYN	14583	-0.000	0.1894	No
147	TIMP2	14627	-0.000	0.1870	No
148	RNF4	14678	-0.000	0.1842	No
149	ME1	14685	-0.000	0.1838	No
150	CD59	14809	-0.000	0.1769	No
151	MT3	14822	-0.000	0.1762	No
152	PDGFB	14907	-0.000	0.1715	No
153	HNF4A	14935	-0.000	0.1700	No
154	PHEX	15001	-0.000	0.1664	No
155	TIMP1	15009	-0.000	0.1660	No
156	PIK3CG	15087	-0.000	0.1616	No
157	GATA3	15127	-0.000	0.1595	No
158	GNAI2	15294	-0.000	0.1501	No
159	GPD2	15307	-0.000	0.1495	No
160	CR2	15362	-0.000	0.1464	No
161	CD46	15363	-0.000	0.1464	No
162	SERPINC1	15374	-0.000	0.1459	No
163	TNFAIP3	15390	-0.000	0.1450	No
164	IRF1	15558	-0.000	0.1356	No
165	RAF1	15736	-0.000	0.1257	No
166	USP15	15824	-0.000	0.1208	No
167	IL6	15843	-0.000	0.1198	No
168	PIM1	15881	-0.000	0.1177	No
169	USP8	15913	-0.000	0.1160	No
170	PLA2G7	16096	-0.000	0.1058	No
171	ZEB1	16148	-0.000	0.1029	No
172	SERPING1	16156	-0.000	0.1025	No
173	PPP4C	16167	-0.000	0.1020	No
174	L3MBTL4	16247	-0.000	0.0975	No
175	FCER1G	16339	-0.000	0.0924	No
176	C1QC	16346	-0.000	0.0921	No
177	C1R	16355	-0.000	0.0916	No
178	CALM3	16366	-0.000	0.0911	No
179	ADAM9	16701	-0.000	0.0723	No
180	ZFPM2	16768	-0.000	0.0686	No
181	CEBPB	16869	-0.000	0.0630	No
182	C1QA	16913	-0.000	0.0606	No
183	VCPIP1	16961	-0.000	0.0579	No
184	CDK5R1	17012	-0.000	0.0551	No
185	F8	17259	-0.000	0.0413	No
186	GNG2	17319	-0.000	0.0380	No
187	S100A13	17407	-0.000	0.0331	No
188	GMFB	17480	-0.000	0.0291	No
189	SRC	17485	-0.000	0.0289	No
190	CALM1	17557	-0.000	0.0249	No
191	F5	17561	-0.000	0.0247	No
192	HSPA1A	17624	-0.000	0.0212	No
193	LYN	17839	-0.000	0.0092	No